图书介绍

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生物信息与数据处理
  • 徐程编著 著
  • 出版社: 北京:高等教育出版社
  • ISBN:7040196255
  • 出版时间:2006
  • 标注页数:172页
  • 文件大小:35MB
  • 文件页数:179页
  • 主题词:生物信息论

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图书目录

第1章 绪论1

1.1 计算机在生命科学领域的应用1

1.2 学习本课程的目的与意义3

1.3 学习本课程的基本方法3

第2章 因特网与网上生物学资源5

2.1 因特网概述5

2.2 因特网的相关概念、提供的服务类型和软件5

2.3 网上生物学信息资源分类12

2.4 计算机检索原理15

2.5 计算机检索基本原理17

2.6 生物文献检索途径19

第3章 搜索引擎与生物学资源导航站点22

3.1 Internet上WWW生物资源的查询途径22

3.2 搜索引擎的查询方法23

3.3 非WWW生物资源检索途径42

3.4 因特网涉及生物学习的资源介绍48

3.5 引用Internet资源的注意事项49

第4章 因特网上的生物学文献数据库51

4.1 文献搜索引擎51

4.2 生物相关文摘型数据库60

4.3 全文数据库介绍71

4.4 会议论文数据库80

4.5 学位论文数据库81

4.6 专利数据库83

4.7 标准数据库86

4.8 获取原文的方法总结87

第5章 特定文献数据库的构建88

5.1 文献管理软件的共同特点88

5.2 Reference Manager软件的使用89

5.3 国产文献管理软件——医学文献王简介101

6.1 文献阅读的意义和方法105

第6章 文献阅读与综述撰写105

6.2 科技综述的写作109

第7章 常用核酸蛋白质数据库介绍112

7.1 常用核酸和蛋白质数据库及文件格式112

7.2 其他注释序列数据库132

7.3 基因组和特殊物种数据库133

7.4 其他数据库134

第8章 生物数据库检索135

8.1 利用SRS(序列检索系统)搜索数据库135

8.2 利用Entrez进行数据库搜索139

8.3 DBGET/LinkDB147

第9章 以序列相似性为准则的数据库搜索148

9.1 序列相似性搜索148

9.2 氨基酸取代矩阵150

9.3 数据库搜索:FASTA和BLAST151

9.4 序列过滤154

9.5 反复数据库搜索和PSI-BLAST155

第10章 PRISM统计分析软件的使用156

10.1 常用统计软件介绍156

10.2 GraphPad Prism使用介绍158

上机实验164

实验1 常用搜索引擎及专业搜索引擎的使用164

实验2 PubMed的使用164

实验3 常用文献数据库及专业数据库检索165

实验4 利用文献管理软件构建文献数据库166

实验5 常用分子生物学数据库检索167

实验6 利用Entrez、SRS工具检索相关核酸蛋白数据库168

实验7 利用Blast进行数据库相似性搜索169

实验8 利用GraphPad Prism 4进行统计分析及作图171

实验9 依给定题目进行文献检索并完成文献综述的写作172

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