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《现代遗传学丛书》序1

序1

前言1

第一章引言1

第一节植物遗传改良与数量性状1

目 录1

第二节 植物育种性状的遗传体系与育种方法2

第三节数量性状遗传体系的检测方法和本书的目的与内容4

第一节数量遗传学的形成与发展8

第二章植物数量性状遗传研究的发展8

第二节植物数量遗传研究的主要内容及其在植物育种中的应用10

一、植物数量遗传研究的主要内容10

二、植物数量遗传理论在育种中的应用14

第三节植物数量性状遗传体系及其检测17

一、关于植物数量性状遗传体系的认识17

二、检测数量性状主基因＋多基因混合遗传模型的研究19

三、植物数量性状遗传体系主基因＋多基因混合遗传模型分离分析方法22

第一节遗传模型及世代平均数的遗传组成26

一、一对等位基因的加性显性遗传模型26

第三章数量性状主基因－多基因遗传体系分离分析的遗传学基础26

二、两对或多对基因的加性－显性遗传模型27

三、势能比值27

四、杂种自交世代及回交世代平均数的遗传组成28

五、加性显性遗传模型的适合性测验31

第二节加性显性遗传模型下各世代的遗传方差组成34

一、遗传方差组成的期望值34

二、遗传方差组成的实验估计39

三、狭义遗传率与显性程度42

一、F2:3家系对F2单株的协方差及回归44

第三节亲属间的协方差44

二、F4与F3世代间的协方差46

第四节有效因子数的估计46

一、利用双亲差数的Castle-Wright公式及Mather公式46

二、利用遗传方差的Panse公式47

第五节具有基因互作（上位性）效应的遗传模型48

一、加性显性－上位性遗传模型下世代平均数的组成48

二、加性显性－上位性遗传模型下世代方差和协方差的组成55

三、连锁条件下的世代平均数与方差56

第六节分子标记与分离分析61

一、经典数量遗传分析中的一些假定63

第四章数量性状分离分析法的混合分布理论63

第一节数量性状遗传体系的基本假定63

二、数量性状遗传体系分离分析的主要遗传假定及其真实性分析64

第二节分离分析的混合分布理论64

一、混合模型的研究历史65

二、混合模型的应用65

三、分离分析法中混合分布的一般理论66

第三节分离世代各种遗传体系的理论图形分析71

一、主基因－多基因性状在F2世代的表型分布特征71

二、主基因＋多基因性状在回交世代和F2:3家系世代的表型分布特征82

三、利用分离世代的图形分析初步鉴定数量性状的遗传体系85

第四节遗传数据与混合分布的相符性及数据变换88

第五节 由实验数据估计分布参数——极大似然估计89

一、极大似然估计的定义90

二、极大似然估计的统计性质91

第六节混合模型中参数极大似然估计的算法91

一、EM算法91

二、ECM算法93

三、IECM算法93

第七节分离世代个体的后验概率94

一、F2群体的遗传模型及其混合分布96

第五章单个分离世代的数量性状分离分析96

第一节 单个分离世代群体的遗传模型及其混合分布96

二、BC1F1的遗传模型及其混合分布102

三、F2:3家系群体的遗传模型及其混合分布106

四、回交衍生家系BC1F1:2群体的遗传模型及其混合分布113

五、DH或RIL群体的遗传模型及其混合分布120

第二节 单世代数量性状分离分析两步法127

一、混合分布的样本似然函数和成分分布个数的估计127

二、主基因＋多基因混合遗传模型的遗传分析128

一、主要步骤129

第三节单世代数量性状分离分析的一步法129

二、极大似然估计的计算130

三、家系重复试验资料的主基因＋多基因混合遗传分析151

四、由分布参数估计遗传参数的方法152

第四节实例分析153

一、利用单个分离世代检测数量性状遗传体系两步法应用举例153

二、利用单个分离世代检测数量性状遗传体系一步法应用举例158

第五节 单个分离世代与不分离世代的联合分析164

一、单个分离世代的局限性及加进P1、P2和F1世代的增益164

二、应用实例166

第六章 多世代联合的数量性状分离分析Ⅰ——P1、F1、P2、F2和F2:3联合分析169

第一节遗传模型和各世代的混合分布170

一、一对主基因遗传模型170

二、两对主基因遗传模型172

三、多基因遗传模型176

四、一对主基因＋多基因混合遗传模型177

五、两对主基因＋多基因混合遗传模型179

第二节似然函数中分布参数极大似然估计的计算189

一、一对主基因遗传模型189

二、两对主基因遗传模型191

三、多基因遗传模型198

四、一对主基因＋多基因遗传模型199

五、二对主基因＋多基因遗传模型203

第三节实例分析215

一、大豆对豆秆黑潜蝇抗性遗传的研究实例215

二、大豆对食叶性害虫抗性发育的遗传研究实例219

第七章多世代联合的数量性状分离分析Ⅱ——P1、F1、P2、B1、B2和F2联合分析224

第一节遗传模型和各世代的混合分布224

一、一对主基因遗传模型224

二、两对主基因遗传模型225

三、多基因遗传模型229

四、一对主基因＋多基因混合遗传模型230

五、两对主基因＋多基因混合遗传模型233

第二节似然函数中分布参数极大似然估计的计算242

一、一对主基因遗传模型242

二、两对主基因244

三、多基因遗传模型248

四、一对主基因＋多基因混合遗传模型248

五、两对主基因＋多基因混合遗传模型252

一、应用实例258

第三节实例分析258

二、MonteCarlo模拟研究260

第八章六家系世代联合重复试验的数量性状分离分析——P1、F1、P2、B1:2、B2:2和F2:3联合分析266

第一节遗传模型和各世代的混合分布266

一、一对主基因遗传模型266

二、两对主基因遗传模型268

三、多基因遗传模型272

四、一对主基因＋多基因混合遗传模型273

五、两对主基因＋多基因混合遗传模型276

一、 一对主基因遗传模型286

第二节 似然函数中分布参数的极大似然估计的计算286

二、两对主基因遗传模型288

三、多基因遗传模型293

四、一对主基因＋多基因混合遗传模型294

五、两对主基因＋多基因混合遗传模型297

第三节实例分析304

一、无重复试验的六家系世代联合的分离分析304

二、有重复试验的六家系世代联合分离分析307

第四节数量性状分离分析中遗传参数标准误的估计310

一、确定遗传参数估计值标准误的Jackknife法311

二、确定遗传参数估计值标准误的Bootstrap抽样法312

第九章QTL遗传体系分离分析方法的应用316

第一节各种世代类型间分离分析方法的比较316

一、各种世代类型的归纳316

二、基本假定317

三、遗传信息318

四、精确度319

第二节植物数量性状遗传体系分离分析方法的应用319

第三节应用中发现的问题与改进途径322

一、试验的精确度322

二、分离比及其推论324

三、单世代分离分析与多世代联合分离分析的一致性325

四、分离分析法应用的扩展326

五、遗传模型的命名体系327

第四节数量性状遗传体系分离分析法和分子标记法的比较与配合328

一、在大豆上做的实验与比较328

二、实验群体与理论群体相符性的检测与调整341

第十章数量性状分离分析的操作方法与算法程序351

第一节遗传试验设计与数据结构351

一、遗传试验设计351

第二节分布参数估计与模型适合性测验353

二、试验数据的结构353

三、数据文件的建立353

第三节遗传参数估计362

第四节 后验概率与主基因型归类365

第五节软件包的结构与使用367

一、单个分离世代数量性状分离分析的算法程序367

二、多个分离世代联合数量性状基因座遗传体系分析算法程序369

参考文献371

中文索引377

英文索引379