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第一章　生态学研究概述1

1.1　生态学研究的基本思想2

1.1.1　层次观2

1.1.2　整体论2

1.1.3　系统学说3

1.1.4　协同进化3

1.2　现代生态学研究的热点问题3

1.2.1　现代生态学研究的特点与内容3

1.2.2　现代生态学研究的热点问题4

1.3　生态学研究的基本方法7

1.3.1　原地观测7

1.3.2　受控实验8

1.3.3　生态学研究的综合方法8

第二章　试验设计与数据统计分析10

2.1　试验设计原理10

2.2　试验设计类型11

2.3　生物统计的常用术语15

2.3.1　总体与样本15

2.3.2　参数与统计量15

2.3.3　准确性与精确性15

2.3.4　随机误差与系统误差16

2.4　平均数、标准差与变异系数16

2.4.1　平均数16

2.4.2　标准差19

2.4.3　变异系数21

2.5　方差分析21

2.5.1　方差分析的意义和作用21

2.5.2　方差分析的基本原理及步骤22

2.5.3　单因素试验资料的方差分析25

2.6　方差分析的数学模型与期望均方27

2.6.1　数学模型27

2.6.2　期望均方28

第三章　取样技术29

3.1　样地制图29

3.1.1　陆地生境制图30

3.1.2　水塘与河流制图32

3.2　简单随机取样34

3.2.1　取样误差35

3.2.2　样本平均数的置信区间35

3.2.3　理论取样数的确定36

3.2.4　样本抽取方法39

3.3　分层取样41

3.3.1　分层取样的样本平均数与样本方差41

3.3.2　分层取样理论取样数的确定42

3.4　标记重捕技术45

3.4.1　标记技术45

3.4.2　Lincoln指数法47

3.4.3　Jolly-Seber随机法48

3.5　种群相对数量的估计52

3.5.1　估计方法52

3.5.2　影响相对数量估计的因素55

3.6　去除取样法55

3.6.1　回归分析法56

3.6.2　三点法56

3.6.3　极大似然法58

3.7　群落数量特征的调查方法59

3.7.1　样方法与种-面积曲线59

3.7.2　样条法62

3.7.3　点样法63

3.7.4　无样地法64

3.8　样本容量的确定64

3.8.1　连续变量65

3.8.2　离散变量67

3.8.3　生态学特有变量68

3.8.4　通用方法与经验方法70

第四章　种群结构与过程研究71

4.1　种群的基本特征71

4.1.1　种群的空间分布71

4.1.2　种群的数量特征74

4.1.3　种群的遗传特征77

4.1.4　邻接效应77

4.2　生命表技术78

4.2.1　特定时间生命表78

4.2.2　特定年龄生命表82

4.2.3　生命表组建方法83

4.3　数学生态模型83

4.3.1　生态学模型的概念84

4.3.2　建立生态模型的一般步骤85

4.3.3　生态模型的一般成分86

4.3.4　生态模型的类型87

4.3.5　建立模型的一般方法88

4.4　种群与种间关系模型89

4.4.1　单种群模型89

4.4.2　双种群模型93

4.4.3　k-种群作用模型（k≥3）98

4.4.4　矩阵模型101

4.4.5　随机模型106

4.4.6　生态位的测度方法113

4.5　种群数量估计114

4.5.1　种群的数量动态114

4.5.2　种群的空间动态117

4.5.3　种群数量调节118

4.5.4　种群数量估计119

第五章　群落结构与生物多样性研究121

5.1　群落结构分析121

5.1.1　生物群落的概念121

5.1.2　地球上群落的主要类型121

5.1.3　群落结构分析124

5.1.4　生物群落的基本特征128

5.1.5　生物群落的种类组成及其数量特征129

5.2　群落动态分析134

5.2.1　生物群落的季节动态134

5.2.2　生物群落的年变化134

5.2.3　经验模型136

5.2.4　群落的演替137

5.2.5　群落的演替模型142

5.3　群落分类与排序144

5.3.1　群落分类144

5.3.2　群落的排序148

5.4　生物多样性研究149

5.4.1　多样性的定义150

5.4.2　物种多样性的研究方法150

5.4.3　物种多样性在空间上的变化规律153

5.4.4　决定多样性梯度的因素154

第六章　生态系统的系统分析方法156

6.1　生态系统的基本知识156

6.1.1　生态系统的概念156

6.1.2　生态系统的组成157

6.1.3　生态系统的基本特征157

6.1.4　生态系统的完整性159

6.1.5　生态循环159

6.1.6　生态系统稳定性160

6.2　生态系统模型161

6.2.1　模型的组成161

6.2.2　建模过程162

6.2.3　模型验证166

6.2.4　灵敏度分析166

6.3　生态系统的能量流动167

6.3.1　能量流动遵循的规律167

6.3.2　生态系统中能量的主要来源167

6.3.3　能量流动遵循的基本热力学定律168

6.3.4　生态系统中的辅助能169

6.3.5　生态系统的能量分析170

6.3.6　农业生态系统能流关系的调整方向177

6.4　生态系统的物质循环179

6.4.1　生态系统物流的一般特点179

6.4.2　物质循环的基本类型181

6.4.3　水循环183

6.4.4　碳循环185

6.4.5　氮循环187

6.4.6　磷循环190

6.4.7　钾循环191

6.4.8　硫循环192

6.4.9　农业生态系统中的养分循环194

6.5　生态系统分析205

6.5.1　分室模型：方法和实例205

6.5.2　湖泊富营养化模型208

6.6　生态系统生产力的测定215

6.6.1　初级生产中的能流分析215

6.6.2　次级生产中的能量流动222

第七章　景观研究方法225

7.1　景观要素225

7.1.1　斑块225

7.1.2　廊道228

7.1.3　基质230

7.1.4　景观异质性231

7.1.5　景观空间格局231

7.1.6　网络233

7.2　景观生态分类与评价235

7.2.1　景观生态分类235

7.2.2　生态系统健康评价237

7.2.3　生态系统综合评价239

7.3　景观生态学研究方法242

7.3.1　3S技术242

7.3.2　景观模型243

7.4　景观规划与设计方法246

7.4.1　景观生态规划的概念与内涵246

7.4.2　景观生态规划的原则246

7.4.3　景观生态规划的步骤247

7.4.4　景观生态规划的类型250

7.5　RS和GIS在景观研究中的应用254

7.5.1　RS及其在景观研究中的应用254

7.5.2　GIS及其在景观研究中的应用258

7.6　地统计学方法在景观研究的应用260

第八章　微生物生态学研究方法268

8.1　微生物生态学研究的传统方法268

8.1.1　样品的采集、富集培养和微生物纯培养的分离268

8.1.2　最大或然值法269

8.1.3　活菌计数法269

8.2　微生物生态学研究的分子生物学方法269

8.2.1　核酸探针杂交技术269

8.2.2　PCR特异性扩增技术270

8.2.3　rRNA基因同源性分析方法271

8.2.4　变性梯度凝胶电泳技术271

8.3　微生物生态模型272

8.3.1　实验模型272

8.3.2　数学模型274

8.3.3　竞争方程式275

8.3.4　共生方程式276

8.3.5　捕食方程式277

8.3.6　生物群落的数学模型278

8.3.7　组建数学模型常用的方法280

第九章　生态环境影响评价方法281

9.1　生态环境影响调查与监测281

9.1.1　生态环境现状调查281

9.1.2　生态环境现状调查项目282

9.2　生态环境现状估计与评价283

9.2.1　物种评价283

9.2.2　群落评价283

9.2.3　栖息地评价283

9.2.4　生态系统完整性评价284

9.2.5　生态环境保护目标及其界定284

9.3　生态环境影响预测与评价285