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第一帙1

神农本经上品一1

六芝（紫芝、青芝、赤芝、黄芝、白芝、黑芝）1

人参3

甘草4

黄芪5

蓍实5

菟丝子6

莲子7

茯苓8

柏子9

云母9

丹砂11

神农本经上品二12

菖蒲12

赤箭（天麻同）14

薯蓣14

干地黄15

枸杞16

菊花17

麦门冬17

太一余粮19

石钟乳19

龙骨20

蜂蜜22

第二帙24

神农本经上品三24

牡桂（箘桂附）24

桑上寄生25

防风25

沙参26

术（苍白同）26

女萎（葳蕤同）27

牛膝28

石斛29

肉苁蓉29

蓬蘽30

蘼芜31

硝石31

朴硝（火硝赤硝同，朴硝芒硝同）32

禹余粮33

滑石33

白石英34

五色石脂34

神农本经上品四35

远志35

蒲黄（蒲灰同）35

泽泻36

茵陈蒿36

巴戟天37

续断37

车前子38

大枣38

女贞实39

辛夷40

松脂40

槐实41

蔓荆实41

小荆实42

龟甲42

牡蛎43

麝脐香44

第三帙46

神农本经上品五46

桑根白皮46

橘柚48

杜仲49

酸枣仁49

决明子50

蒺藜（同沙苑）50

五味子51

芡实52

大麻仁52

独活（羌活同）53

天门冬53

菴？子54

茺蔚子（即益母子）54

蛇床子55

丹参55

细辛55

白胶（即鹿角胶，鹿茸附）56

神农本经上品六57

兰草57

薏苡仁58

地肤子58

蓝实59

木香60

王不留行60

黄连60

葵子61

龙胆62

景天62

干漆63

卷柏63

紫石英63

矾石64

空青65

曾青65

阿胶66

蜜蜡66

桑螵蛸67

第四帙68

神农本经中品一68

玄参68

水苏（一名紫苏，荏子即白苏，荠苧即青苏）68

假苏（一名荆芥）69

麻黄69

葛根70

竹叶71

桃核仁74

杏核仁75

发髲（剪剃者发髲，梳脱者乱发）76

犀角77

羚羊角78

蚱蝉78

神农本经中品二79

水萍（浮萍同）79

牡丹79

枲耳实（即苍耳）82

当归83

芍药83

款冬花84

芎85

阳起石85

雄黄86

雌黄86

牛角？87

鳖甲88

白僵蚕88

第五帙90

神农本经中品三90

石膏90

磁石90

石韦91

藁本91

茜草根92

紫葳92

白芷92

防己93

狗脊93

通草（一名木通）94

秦艽94

栝楼根实95

百合95

栀子96

秦皮96

芜荑96

枳实（枳壳同）96

牛黄97

神经本经中品四98

？虫98

羖羊角98

白茅99

紫菀100

瞿麦101

贝母101

女菀（即葳蕤）102

黄芩102

萆薢102

猪苓103

茈胡103

地榆104

合欢104

秦椒105

蘖木（蘖音百）105

厚朴105

梅实106

吴茱萸106

第六帙108

神农本经中品五108

海螵蛸108

海藻108

淫羊藿109

青蒿109

干姜110

苦参110

知母111

白薇111

紫草112

葱茎白112

泽兰113

白鲜根皮113

山茱萸113

赤小豆114

大豆黄卷114

水银114

石硫黄115

白马阴茎116

牡狗阴茎117

神农本经下品一118

代赭石118

戎盐118

贯众119

白及119

连翘120

白蔹120

乌头121

附子121

天雄122

半夏122

虎掌（天南星同）123

常山（蜀漆附）123

芫花124

大黄124

蚤休125

鬼臼125

巴豆126

大戟126

第七帙128

神农本经下品二128

商陆128

甘遂128

狼毒128

葶苈129

桔梗129

夏枯草130

旋覆花130

青葙131

瓜蒂131

羊蹄132

藜芦132

射干132

萹蓄133

雷丸133

郁李仁134

楝实134

蜀椒134

皂荚135

夜明砂135

猪悬蹄甲136

豚卵136

神农食经137

茗137

第八帙148

别录上品148

黄精148

升麻148

豆蔻149

忍冬150

芥茎叶（芥子、白芥子附）150

饴糖151

沉香（附奇南）152

鸡舌香（丁香附）153

熏陆香（即乳香）153

龙脑香（即冰片）154

枇杷叶154

琥珀155

珍珠156

酥157

别录中品一157

莎草（即香附子）157

香薷159

蘖米（麦蘗、广麦蘖、黍蘖、稷蘖 、稻蘖、菽蘖、蘖俗谷芽）160

大豆豉161

龙眼162

柿163

楮实163

别录中品二164

大青164

高良姜164

黍165

稷165

大麦165

小麦166

粱166

粟166

艾叶167

槟榔167

乳汁168

虎骨169

第九帙171

别录下品171

鲮鲤甲（即穿山甲）171

五灵脂171

人尿172

木瓜172

棕榈173

钩藤173

马勃173

牵牛子174

昆布174

鼠耳175

白前175

扁豆176

稻176

大蓟（小蓟、红蓝花、洎夫蓝附）177

唐本草178

郁金178

姜黄178

蘹香（蘹俗称茴）178

薄荷179

三白草179

刘寄奴草180

蓖麻180

莱菔子181

薰草182

苏方木182

椿樗183

山楂183

诃黎勒（俗称诃子）183

无食子184

麒麟竭（俗称血竭）184

紫矿185

阿魏185

醍醐186

溺白垽186

硇砂186

孙思邈187

牦牛酥187

药性论187

土茯苓187

神曲187

宋嘉祐188

藿香188

萱草189

木贼189

山慈菇189

胡芦巴190

海金砂190

礞石191

花乳石191

水银粉（粉霜附）191

妇人月水192

第十帙194

蜀本草194

金樱子194

本草拾遗194

人胞194

日华本草195

硼砂195

宋开实一195

芦荟195

没药196

竹黄196

荔枝197

何首乌198

缩砂密（俗称砂仁）199

骨碎补200

补骨脂（俗称破故纸）200

益智子201

仙茅201

白花蛇202

宋开实二203

柽柳（即西河柳）203

使君子204

乌药204

五倍子204

荜茇205

南烛205

马兜铃206

荆三棱206

谷精草206

延胡索207

灯心草208

白豆蔻208

肉豆蔻208

山豆根209

密蒙花209

威灵仙209

甘松香210

续随子210

蓬莪荗211

木鳖子211

法象211

通脱木（俗用葱草）211

补遗212

红曲212

会编212

虫白蜡212

蒙筌213

秋石213

本草纲目214

大风子214

蜀粟214

玉蜀粟214

山柰214

淡竹叶215

紫花地丁215

第十一帙216

神农本经上品216

文蛤216

五加皮216

神农本经中品217

荛花217

紫参217

败酱218

露蜂房218

蛴螬219

丹雄鸡（附鸡子、鸡子白、鸡子黄、卵壳、鸡屎白）219

隐居别录219

蜚虻（即虻虫）221

神农本经下品221

梓白皮221

白头翁222

泽漆222

狼牙223

胡粉223

蜣螂224

鼠妇224

水蛭224

别录上品225

李根白皮225

羊肉225

别录中品226

薤226

瓜子仁227

恶实（一名牛蒡子、鼠粘子）227

酒227

别录下品229

蒴藋细叶229

芦根229

苎麻229

白附子230

灶心黄土（即伏龙肝）230

醋230

猪胆231

蜘蛛231

唐本草232

鳢肠（即旱莲草）232

豨莶232

救荒本草233

土瓜（即苦瓜、俗称锦荔枝）233

宋嘉祐233

浆水233

宋开宝234

白鱼234

日华234

浮石234

铅丹（即飞丹）235

证类235

降真香（新绛同）235

纲目236

潦水236

李时珍237

柏叶237

拾遗237

裈裆237