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1 有机质的起源和保存1

1.1 生物标志化合物的简介1

1.2 生命活动的范围1

1.3 初级生产率4

1.4 二级生产率6

1.5 有机质的保存7

1.6 岩石中的有机成分8

1.7 含氧与缺氧沉积9

1.8 沉积速率与颗粒的大小12

1.9 湖泊与海相沉积环境14

1.10 烃源岩的时间和区间分布15

2 有机化学16

2.1 烷烃：σ键17

2.2 烷烃：π键17

2.3 芳香族：苯18

2.4 结构表示法18

2.5 三维在二维空间的投影19

2.6 无环烷烃20

2.7 无环烯烃22

2.8 单环烷烃23

2.9 多环环烷烃24

2.10 异戊二烯法则25

2.11 芳香烃30

2.12 杂环芳构分子30

2.13 立体化学及命名33

2.14 手性34

2.15 光学活性35

2.16 不对称中心的命名（R、S、α和β）36

2.17 立体异构化40

2.18 特定生物标志物的立体化学41

2.19 练习46

3 生物标志化合物的生物化学47

3.1 类脂膜47

3.2 细胞膜类脂49

3.3 类脂膜的流动性52

3.4 萜类化合物的生物合成54

3.5 生物圈和岩石圈中的藿烷类化合物和甾醇60

3.6 光合作用下的卟啉和其他生物标志物67

3.7 类胡萝卜素72

4 样品的地球化学筛选76

4.1 烃源岩的筛选：质量和数量76

4.2 烃源岩的筛选：热成熟度92

4.3 地球化学测井数据和生烃潜力指数99

4.4 原始烃源岩生烃潜力的恢复101

4.5 原生沥青的检测104

4.6 远景储集岩中原油的检测105

4.7 原油的筛选105

4.8 储层的连通性和充注史113

4.9 采用活塞岩心进行地表地球化学勘探116

4.10 样品的质量、筛选和储存118

4.11 岩石和原油的地球化学标准121

4.12 附录：质量平衡公式的推导122

5 炼制原油的检测125

5.1 原油检测的基本方法126

5.2 先进的原油检测方法133

5.3 石油的炼制135

5.4 炼制产物中的生物标志化合物138

6 稳定同位素比值141

6.1 标准及符号表示法142

6.2 稳定碳同位素测定142

6.3 稳定碳同位素分馏143

6.4 应用不同的标准转换δ值145

6.5 稳定碳同位素比值的应用145

6.6 特征化合物同位素分析（CSIA）155

6.7 硫和氢同位素160

7 辅助性的地球化学方法165

7.1 金刚烷类化合物165

7.2 C7烃类分析171

7.3 轻烃的特征化合物同位素分析203

7.4 分子建模205

7.5 流体包裹体206

8 生物标志化合物的分离与分析210

8.1 生物标志化合物实验室的构成210

8.2 样品的清洗与分离210

8.3 内标物及初步分析213

8.4 沸石分子筛214

8.5 气相色谱-质谱法220

8.6 质谱与化合物鉴定248

8.7 生物标志化合物的定量分析250

9 石油的成因260

9.1 历史背景260

9.2 地球深部气体假说262

9.3 非生物成因烃类气体264

9.4 石油热成因假说267

10 生物标志化合物在环境评价中的应用280

10.1 环境标记物280

10.2 原油泄漏282

10.3 影响海洋泄油命运的过程285

10.4 缓解原油泄漏的危害288

10.5 海洋原油泄漏的模拟288

10.6 陆上的原油泄漏290

10.7 地下泄漏290

10.8 石油的毒性291

10.9 环境化学场与实验室的流程293

10.10 泄漏原油的化学指纹295

10.11 泄油研究中的生物标志化合物和多环芳香烃分析299

10.12 生物标志化合物和多环芳香烃在原油泄漏研究中的应用304

10.13 生物标志化合物与“埃克森·瓦尔迪兹”号泄油310

10.14 背景成岩成因烃类的来源：煤与油苗假说的对垒314

10.15 作为污染物的汽油及其他轻质燃料318

10.16 作为污染物的天然气321

10.17 烟雾中的生物标志化合物324

11 生物标志化合物在考古学中的应用327

11.1 人类的时代327

11.2 古代含石油物质的起源和运输328

11.3 考古中的树胶和树脂333

11.4 艺术品中的生物标志化合物338

11.5 考古中的木焦油（沥青）340

11.6 古代饮食和农业活动342

11.7 考古中的蜂蜡349

11.8 生物标志化合物与施肥实践351

11.9 考古中的脱氧核糖核酸（DNA）352

11.10 古代蛋白质354

11.11 考古中的麻醉剂355

11.12 生物标志化合物及交叉学科的研究357

参考文献359