图书介绍
蛋白质组学实验技术精编2025|PDF|Epub|mobi|kindle电子书版本百度云盘下载
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- 魏开华,应天翼等编著 著
- 出版社: 北京:化学工业出版社
- ISBN:9787122091345
- 出版时间:2010
- 标注页数:187页
- 文件大小:42MB
- 文件页数:196页
- 主题词:蛋白质-基因组-实验
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图书目录
第1章 蛋白质组学概论1
1.1蛋白质组学研究的背景1
1.2蛋白质组学的分类1
1.3蛋白质组学的主要应用2
1.4蛋白质组学的研究策略3
1.5蛋白质组技术的最新进展4
1.5.1定量蛋白质组研究策略4
1.5.2串联多维分离策略5
1.5.3蛋白质磷酸化分析策略6
1.5.4蛋白质复合体分析策略6
1.5.5细胞器蛋白质组分析策略6
1.5.6生物标志物的质谱验证策略6
1.6发展趋势6
参考文献7
第2章 双向电泳实验设计与统计分析8
2.1统计学方法简述8
2.2实验设计8
2.2.1基本方法8
2.2.2含区组因素的双向电泳实验设计12
2.2.3如何合理进行随机化分组14
参考文献15
第3章 双向凝胶电泳16
3.1样品制备16
3.1.1基本概念与原则16
3.1.2实验方案范例20
3.1.3常见问题与解析24
3.2蛋白质定量26
3.2.1 BCA法26
3.2.2 Bradford法29
3.3第一向等电聚焦(IEF)31
3.3.1 IPG胶条、IPG缓冲液与水化液31
3.3.2上样32
3.3.3常见问题33
3.4第二向SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳39
3.4.1 SDS-PAGE凝胶的灌制39
3.4.2胶条的平衡与转移41
3.4.3聚丙烯酰胺凝胶电泳41
3.4.4常见问题41
3.5凝胶的染色47
3.5.1蛋白质组学实验中聚丙烯酰胺凝胶的考马斯亮蓝染色47
3.5.2蛋白质银染色法49
3.5.3二价锌离子负染法54
3.5.4糖蛋白的检测56
3.6转印57
3.6.1半干转印58
3.6.2垂直槽转印58
3.6.3丽春红染色58
3.6.4常见问题59
3.7胶内酶解61
3.7.1实验步骤61
3.7.2常见问题62
3.8差异荧光表达分析系统64
3.8.1实验步骤64
3.8.2常见问题66
3.9 Blue Native PAGE电泳66
3.9.1实验步骤67
3.9.2常见问题70
参考文献72
第4章 MALDI-TOF质谱技术与问题解析78
4.1 MALDI-TOF质谱简介78
4.1.1 MALDI-TOF质谱仪78
4.1.2 MALDI的基质79
4.1.3 MALDI-TOF质谱基本操作81
4.2肽质量指纹谱技术83
4.3 PSD或TOF/TOF肽序列标签技术84
4.4临床蛋白质组学技术86
4.4.1原位蛋白质组学86
4.4.2液体蛋白质芯片与血清多肽组学87
4.5 MALDI质谱仪器的维护与注意事项88
4.5.1日常仪器维护88
4.5.2样品检测注意事项89
4.6常见问题分析89
参考文献98
第5章 纳升电喷雾串联质谱技术与问题解析100
5.1电喷雾串联质谱简介100
5.1.1电喷雾电离基本原理100
5.1.2电喷雾质谱的特点100
5.2多肽测序与蛋白质鉴定101
5.2.1多肽测序101
5.2.2蛋白质鉴定103
5.3无标记定量蛋白质组研究104
5.3.1基本原理104
5.3.2基于质谱峰强度的定量方法的一般步骤105
5.3.3应用实例105
5.4蛋白质磷酸化分析110
5.4.1前言110
5.4.2磷酸化蛋白质的分离和检测111
5.4.3磷酸肽的分离112
5.5离子淌度质谱及其应用116
5.5.1基本原理116
5.5.2在蛋白质组研究中的典型应用117
5.5.3展望119
5.6多维色谱串联质谱联用技术119
5.6.1基于多维色谱分离的蛋白质组研究基本原理119
5.6.2主要应用及需要解决的关键问题120
5.6.3展望122
5.7常规操作、仪器维护与注意事项122
5.7.1 Q-TOF质谱仪的日常操作(Waters公司)122
5.7.2 Qstar (AB公司)123
5.7.3 Bruker HCT电喷雾质谱仪的基本操作规程124
5.8常见问题解析124
参考文献147
第6章 蛋白质组数据分析技术149
6.1生物信息学简介149
6.2蛋白质组数据库149
6.3双向电泳数据库151
6.4生物信息学网站与工具软件152
6.5 MOWSE算法与结果评估154
6.6蛋白质鉴定与数据库检索方法(Mascot)156
6.6.1 Mascot检索参数156
6.6.2数据文件格式160
6.6.3肽的裂解164
6.6.4序列查询166
6.6.5查询结果解析167
6.7 PMF与MS/MS数据组合查库方法170
6.7.1操作流程171
6.7.2结果示例172
6.8串联质谱数据搜库结果质量控制方法173
6.8.1串联质谱数据搜库结果质量控制的研究现状和问题173
6.8.2结果数据集的质量评价参数174
6.8.3搜库参数优化174
6.8.4展望175
6.9 Mascot的安装与使用简介175
6.10常见问题解析177
参考文献187
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