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第1章 绪论1

“第六次大灭绝”1

为什么要保护生物多样性？2

濒危与灭绝的物种2

什么是濒危物种？4

物种灭绝的原因5

认识保护生物学中遗传因素的重要性6

什么是保育遗传学？6

怎样通过遗传学方法减缓物种灭绝？7

保护生物学中的遗传因素与群口和环境因素11

濒危物种的遗传管理11

保育遗传学的方法学12

岛屿居群12

资料来源13

小结13

主要参考书目13

习题13

实践操作：濒危物种的划分14

第2章　遗传学理论与灭绝15

遗传学与濒危物种的命运15

近交与灭绝的关系18

自然居群中的近交与灭绝19

遗传多样性丧失与灭绝的关系24

小结25

推荐阅读26

习题26

实践操作：计算机模拟26

第一篇 自然居群的进化遗传学28

第3章　遗传多样性29

遗传多样性的重要性29

什么是遗传多样性？30

遗传多样性的检测32

遗传多样性的含义39

濒危物种中低水平的遗传多样性43

遗传多样性如何决定物种的进化潜力？43

遗传多样性的时空格局43

影响遗传多样性水平的因素44

种间的遗传差异45

小结45

推荐阅读45

习题45

实践操作：采用微卫星技术测度遗传多样性45

第4章 遗传多样性描述：单个位点47

遗传多样性的描述方法47

等位基因与基因型的频率47

哈迪-温伯格平衡49

预期杂合度51

偏离哈迪-温伯格平衡54

哈迪-温伯格平衡的拓展55

多位点连锁的不平衡58

小结60

推荐阅读61

习题61

第5章　遗传多样性描述：数量变异63

数量性状的重要性63

数量性状的特点64

数量性状遗传变异的基础65

数量性状遗传变异的检测方法67

遗传变异与环境变异的分解68

基因型×环境互作69

同期比较与对照居群的必要性70

数量性状遗传变异的分解71

进化潜力与遗传力72

对近交衰退的敏感性78

分子遗传变异与数量性状遗传变异间的相互关系78

数量性状遗传变异的组成79

小结79

推荐阅读79

习题80

第6章　大居群的进化：Ⅰ．自然选择与适应81

进化的必要性81

影响居群进化的因素84

选择85

数量性状的选择92

定向选择93

稳定选择95

分裂选择95

小结95

推荐阅读96

习题96

实践操作：计算机模拟97

第7章　大居群的进化：Ⅱ．突变、迁徙以及与选择的相互作用98

影响居群进化的因素98

变异和迁徙的重要性以及与它们在保育中与选择的相互作用98

遗传多样性的来源与再生99

突变99

突变的选择价值102

突变-选择平衡与突变沉积103

迁徙105

迁徙与选择的平衡以及梯度变异107

小结109

推荐阅读109

习题109

第8章　小居群的进化111

小居群在保护生物学中的重要性111

小居群大小的影响：随机效应113

近交119

居群大小的检测119

小居群中的选择作用120

小居群中的突变121

小居群中的突变-选择平衡122

计算机模拟122

小结123

推荐阅读123

习题124

实践操作：计算机模拟124

第9章　遗传多样性的维持126

遗传多样性的保护126

不同类别突变的命运127

大居群中遗传多样性的维持128

随机遗传漂变下的中性突变128

不同性状间的选择强度130

平衡选择131

小居群中遗传多样性的维持137

小结142

推荐阅读142

习题142

实践操作：计算机模拟143

第二篇　居群减小的效应145

第10章　小居群中的遗传多样性丧失146

遗传多样性随时间的变化146

遗传多样性丧失与健康度下降的关系147

长期限制居群大小对遗传多样性的影响148

自然居群大小与遗传多样性的关系151

有效居群大小153

有效居群大小的测定154

小结160

推荐阅读161

习题161

实践操作：计算机模拟161

第11章　近交162

什么是近交？162

保育学关注的近交问题163

近交系数F163

近交的遗传后果165

小居群中的近交167

系谱分析170

自然繁育系统172

近交的常规系统172

近交中突变与选择的平衡173

多倍体中的近交174

近交、杂合度、遗传多样性与居群大小的关系175

小结175

推荐阅读176

习题176

第12章　近交衰退177

自然条件下远交物种的近交衰退177

野生居群的近交衰退178

由小居群引起的近交衰退180

近交与灭绝180

近交衰退的特征181

近交衰退的遗传学基础183

遗传清除185

近交衰退的检测188

近交与居群生存力189

近交衰退的恢复191

小结192

推荐阅读192

习题193

第13章　片断化居群194

生境片断化194

居群片断化194

居群结构196

完全孤立的片断化居群197

居群片断化的测定：F-统计值203

片断化居群中的基因流205

基因流的测定206

不同居群结构对生殖健康度的影响208

小结209

推荐阅读209

习题209

第14章　遗传上可存活居群211

濒危物种的生存空间减少211

多大的居群才能存活？213

维持生殖健康度213

维持进化潜力214

濒危居群的尺度范围？216

有效居群大小Ne<500物种的处境216

单个位点遗传多样性的长期保持219

恢复遗传多样性所需的时间219

避免有害新突变的积累219

野生居群遗传管理的目标220

圈育居群遗传管理的目标——一种折中221

可存活小居群的谬论223

小结224

推荐阅读224

习题224

第三篇　从理论到实践226

第15章　疑难分类群的界定与确立管理单元228

准确分类对保护生物学的重要性228

什么是种？230

亚种231

高分类阶元231

种是如何形成的？232

用遗传标记界定同域种234

用遗传标记界定异域种234

计算居群间遗传差异：遗传距离236

构建系统发育树238

远交衰退240

确定种内的管理单元241

小结244

推荐阅读244

习题244

实践操作：构建系统发育树245

第16章　遗传学与野生居群的管理246

野生居群的遗传学问题246

确定物种分类地位与划定管理单元248

增加居群大小248

遗传问题的诊断249

恢复遗传多样性低的近交小居群249

片断化居群的遗传管理252

保护区设计中的遗传学问题255

渐渗与杂交256

捕猎与采收的影响257

二倍体非远交物种的遗传管理258

小结259

推荐阅读260

习题260

第17章　圈育居群的遗传管理261

为什么要圈育？261

圈育与回归引种的步骤263

创建圈育居群264

圈育居群的生长265

圈育居群遗传管理266

当前的圈育居群遗传管理267

群组的圈育管理273

植物的迁地保护274

繁殖技术与基因组资源库275

濒危物种中遗传性疾病的控制276

小结277

推荐阅读277

习题278

第18章 回归引种中的遗传管理279

回归引种279

圈育的遗传改变影响回归引种成功率282

圈育居群的遗传适应282

回归引种的遗传管理287

回归引种的成功率如何？289

辅助繁育290

圈育繁育与回归引种的案例291

小结293

推荐阅读293

习题294

第19章 遗传标记在物种鉴定与物种生物学中的应用295

物种鉴定：监测非法捕猎与采收295

了解物种生物学对物种保育的重要性297

基因树与溯祖298

居群大小与群口历史301

居群结构与基因流304

回归引种与移育307

繁育、亲本分析、奠基者关系与性别鉴定308

病害312

食物构成313

小结313

推荐阅读313

习题313

第20章　居群生存力分析（PVA）315

是什么导致物种的濒危与灭绝？315

灭绝可能性的预测：居群生存力分析（PVA）318

受威胁居群的恢复324

居群生存力分析预测的作用？327

历史教训328

最小可存活居群的大小（MVP）329

小结330

推荐阅读331

习题331

实践操作：居群生存力分析331

本书重要信息扼要332

改编的问题333

术语表334

习题答案341

参考文献349

名词索引375

后记384