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上篇 药学分子生物学基础2

绪论2

第一章 基因与基因组6

第一节 基因6

一、概念及其分类6

二、基因的结构与功能7

第二节 基因组12

一、原核生物基因组13

二、真核生物基因组13

第三节 基因组学18

一、基因组学概述18

二、人类基因组计划20

第二章 DNA的复制、损伤与修复22

第一节 DNA复制22

一、DNA复制的一般特征22

二、特殊类型的复制32

三、阻止DNA复制的药物40

第二节 DNA损伤40

一、DNA损伤类型41

二、DNA损伤在药物评价中应用44

第三节 DNA的修复45

一、复制修复45

二、损伤修复47

三、复制后修复48

四、限制与修饰50

五、DNA损伤修复系统与药物50

第三章 转录及其调控51

第一节 原核生物转录51

一、原核生物转录模板、酶及相关因子51

二、原核生物转录过程53

第二节 真核生物转录55

一、真核生物转录酶及相关因子55

二、真核生物转录过程57

三、真核生物RNA成熟58

第三节 转录调控64

一、原核生物转录调控64

二、真核生物转录调控68

第四节 转录及其调控系统与药物74

一、与DNA形成复合体从而影响转录的药物74

二、选择性结合原核生物RNA聚合酶的药物74

第四章 翻译及其调控76

第一节 蛋白质的生物合成76

一、蛋白质的合成体系76

二、蛋白质合成的过程81

三、非核糖体肽链的合成89

第二节 蛋白质合成后的折叠与加工90

一、蛋白质合成后的折叠90

二、蛋白质合成后的加工93

第三节 蛋白质的转运与定位94

一、蛋白质的转运94

二、蛋白质的定位97

第四节 蛋白质合成的调控100

一、蛋白质合成速率的调节100

二、蛋白质降解速率的调节101

第五节 蛋白质合成与药物102

一、蛋白质合成系统与药物102

二、蛋白质合成调控系统与药物103

第五章 细胞信号转导基础108

第一节 信号转导的概述108

一、信号分子与受体108

二、信号转导的基本过程111

第二节 主要信号转导途径113

一、G蛋白偶联受体信号转导途径113

二、酶偶联受体信号转导途径118

三、依赖于受调蛋白水解信号转导途径123

四、胞内受体信号转导途径124

第三节 细胞信号转导的特性125

一、信号转导一过性与记忆性125

二、信号转导效应的调控126

三、信号转导途径之间的相互作用127

第四节 信号转导与分子靶向药物131

一、信号转导与药物作用靶点131

二、细胞信号转导与靶向抗肿瘤药物132

三、细胞信号转导与靶向其他药物133

第六章 常用分子生物学技术135

第一节 分子杂交技术135

一、Southern印迹135

二、Northern印迹136

三、Western印迹136

四、原位杂交137

五、生物芯片137

第二节 目的基因制备技术139

一、聚合酶链反应139

二、cDNA文库141

三、化学合成142

第三节 基因敲除技术143

一、基因敲除的一般原理143

二、基因敲除载体构建144

三、基因敲除载体导入ES细胞145

四、筛选与鉴定145

五、基因敲除动物产生148

第四节 RNA干扰技术148

一、RNAi的发现149

二、RNAi的作用机制149

三、RNAi的作用特点149

四、siRNA的设计与制备150

五、RNA干扰技术的生物学意义及其在药学中的应用150

第五节 CRISPR/Cas9系统介导的基因组编辑技术150

一、CRISPR/Cas系统的发现151

二、CRISPR/Cas系统的结构和组成151

三、CRISPR/Cas9系统的作用机制152

第六节 分子间的相互作用概述153

一、DNA和蛋白质相互作用153

二、蛋白质和蛋白质相互作用154

下篇 药学分子生物学应用158

第七章 药物基因组学158

第一节 概述158

一、药物基因组学158

二、单核苷酸多态性与单体型160

三、药物基因组学研究方法163

第二节 药物基因组学与精准医疗164

一、遗传变异与药物应答164

二、基因检测与合理用药167

第三节 药物基因组学与药物研发173

一、靶分子发现和药物设计173

二、药物临床试验176

三、药物审批178

第八章 药物转录组学180

第一节 转录组学概述180

一、转录组180

二、转录组与基因组的关系180

三、转录组学181

第二节 转录组学在药学中的应用188

一、药靶候选基因的鉴定188

二、反义药物和siRNA药物188

三、转录组学在药用植物中的应用190

四、转录组在代谢工程领域的应用191

第九章 药物蛋白质组学192

第一节 蛋白质组学概述192

一、蛋白质组学193

二、蛋白质组与转录组的关系194

三、蛋白质组学的主要研究技术195

第二节 蛋白质组学在药学中的应用204

一、药物蛋白质组学概述204

二、药物蛋白质组学应用204

第十章 药物代谢组学216

第一节 代谢组学概述216

一、代谢组学216

二、代谢组学与基因组学、转录组学和蛋白质组学的关系216

三、代谢组学的研究方法和分析技术218

第二节 代谢组学在药学中的应用222

一、代谢组学与个体化药物治疗223

二、代谢组学与药物作用机制研究225

三、代谢组学与药物研发226

第十一章 外源基因表达与基因工程药物231

第一节 概述231

一、基因表达基本原理231

二、基因表达基本类型231

第二节 外源基因表达基本过程232

一、目的基因的获得232

二、目的基因与表达载体的重组233

三、重组表达载体导入宿主细胞及其筛选与确认237

四、目的基因表达240

第三节 原核细胞表达系统242

一、表达载体242

二、表达宿主细胞244

第四节 真核细胞表达系统245

一、酵母细胞表达系统245

二、昆虫细胞表达系统247

三、哺乳动物细胞表达系统248

第五节 重组基因工程药物249

一、重组人胰岛素及其突变体249

二、重组人凝血因子Ⅷ251

三、重组人尿激酶与尿激酶原252

四、重组人生长激素253

五、治疗性单克隆抗体——曲妥珠单抗253

第十二章 药物生物信息学基础256

第一节 生物信息学概述256

一、生物数据库及其查询256

二、序列分析263

第二节 生物信息学在药学中的应用268

一、蛋白类结构预测和模拟269

二、药物靶标的发现273

三、计算机辅助药物设计274

四、在新药开发临床研究阶段的应用277

五、在中药研究中的应用278

参考文献279

中英文对照索引281