图书介绍

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常用生物数据分析软件
  • 王俊，丛丽娟，郑洪坤著 著
  • 出版社： 北京：科学出版社
  • ISBN：7030206223
  • 出版时间：2008
  • 标注页数：364页
  • 文件大小：79MB
  • 文件页数：372页
  • 主题词：生物学－应用软件

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图书目录

第1章 Unix／Linux操作系统介绍1

1.1远程登录1

1.2文件的复制、删除和移动命令6

1.3目录的创建、删除及更改目录命令8

1.4文本查看命令10

1.5文本处理命令12

1.6改变文件或目录的权限命令14

1.7备份与压缩命令16

1.8磁盘及系统管理18

1.9软件安装简介20

1.10其他20

第2章 数据的基本处理22

2.1数据常用格式介绍22

2.2测序原理介绍32

2.3峰图转化（Phred ）33

2.4文件转换（phd2fasta ）40

2.5载体屏蔽（cross_match）43

2.6序列聚类拼接51

2.7 Consed63

2.8引物设计（Primer3）77

主要参考文献82

第3章 序列的比对83

3.1全局比对85

3.2局部比对105

主要参考文献158

第4章 基因组／基因的注释160

4.1重复序列分析160

4.2 RNA分析177

4.3基因预测198

4.4基因功能注释219

主要参考文献229

第5章 SNP分析231

5.1 Polyphred232

5.2 SNPdetector237

5.3 cross_match244

主要参考文献248

第6章 进化分析专题249

6.1 Phylip250

6.2 Paml257

6.3 KaKs_ Calculator263

6.4 FGF270

6.5 MEGA282

主要参考文献286

第7章 基因表达分析专题287

7.1 EST表达序列标签分析287

7.2生物芯片分析307

7.3 Motif预测321

主要参考文献341

第8章 蛋白质结构预测343

8.1蛋白质结构知识介绍343

8.2蛋白质结构预测方法350

8.3蛋白质结构预测的Threading方法350

8.4蛋白质三维结构预测流程介绍351

主要参考文献363

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