生态学数据分析 方法、程序与软件2025|PDF|Epub|mobi|kindle电子书版本百度云盘下载

生态学数据分析 方法、程序与软件PDF格式电子书版下载

注意：本站所有压缩包均有解压码： 点击下载压缩包解压工具

第一章 生态学数据收集1

第一节 样方设置1

一、主观取样1

二、客观取样1

第二节 样方形状、大小和数目2

一、样方的形状2

二、样方的大小3

三、样方的数目3

第三节 无样地取样法4

第二章 群落数量和环境特征6

第一节 群落的数量特征6

一、多度6

二、密度6

三、盖度7

四、频度8

五、高度8

六、生物量和产量8

七、优势度和生态重要值8

八、生活型8

九、种—面积曲线和群落最小面积9

第二节 环境特征9

一、气候数据9

二、地形数据10

三、土壤数据10

四、水体环境10

五、生物因子数据11

第三章 数据准备12

第一节 数据的类型12

一、名称数据12

二、顺序性数据12

三、数量数据13

四、数据矩阵13

第二节 数据预处理14

一、数据简缩14

二、数据转换14

三、数据标准化14

第三节 QBASIC编程17

第四章 回归分析25

第一节 应用CurveExpert进行函数拟合25

一、CurveExpert软件简介25

二、操作步骤25

第二节 应用SPSS进行曲线拟合29

第三节 运用Excel电子表格进行变量关系拟合31

第四节 多元线性回归31

第五章 多样性指数计算34

第一节 生物多样性概述34

第二节 遗传多样性34

一、取样方法34

二、遗传多样性标记介绍35

三、分子数据分析方法37

四、应用Popgen32计算群体遗传多样性和分化40

第三节 物种多样性45

一、物种多样性的概念45

二、α物种多样性计算公式45

三、β物种多样性计算公式48

四、物种多样性的计算程序和软件48

第六章 种间关系分析52

第一节 相关分析52

一、连续数据的相关性分析52

二、二元数据的双系列相关系数52

第二节 种间关联53

第三节 种间相关54

一、Pearson相关系数54

二、Spearman秩相关系数56

三、应用SPSS计算Pearson和Spearman秩相关系数57

四、应用PAST计算Pearson相关系数和Spearman秩相关系数58

五、应用QBASIC程序计算变量之间的相关性59

第七章 生态位61

第一节 生态位概念61

第二节 生态位指数计算61

一、生态位宽度61

二、生态位重叠值63

第八章 空间格局分析90

第一节 空间格局的概念90

第二节 分布格局类型的判定方法90

一、方差均值比91

二、x2检验91

三、ψ检验92

四、Morisita指数93

五、CA扩散指数93

六、平均拥挤度93

第三节 格局分析方法95

一、单种格局规模分析95

二、种群分布格局的斑块间隙、斑块大小分析100

第九章 群落数量分类方法103

第一节 分类的目的和意义103

第二节 相似系数和相异系数103

一、仅适合二元数据的相似关系103

二、适用于二元数据和数量数据的相似关系106

第三节 等级聚类方法108

一、等级聚类的一般步骤108

二、应用PCORD软件进行聚类分析112

三、应用PAST软件进行聚类分析117

四、应用SPSS进行聚类分析118

第四节 等级划分法120

一、单元划分法120

二、双向指示种分析法122

第五节 非等级分类方法125

一、相似分类法125

二、相异分类法125

三、图论聚类法126

第十章 排序129

第一节 排序概述129

第二节 极点排序130

一、方法简介130

二、应用PCORD进行极点排序133

第三节 主成分分析137

一、主成分分析概述137

二、主成分分析的原理137

三、计算步骤139

四、应用SPSS 11.0进行主成分分析142

五、应用PAST 2.1 7进行主成分分析144

六、应用PCORD进行主成分分析147

第四节 主坐标排序149

一、方法介绍149

二、应用PAST进行主坐标排序150

第五节 对应分析和除趋势对应分析151

一、对应分析151

二、除趋势对应分析154

三、应用PAST进行对应分析和除趋势对应分析156

四、应用PCORD进行对应分析和除趋势对应分析158

第六节 典范对应分析和除趋势典范对应分析160

一、典范对应分析160

二、除趋势典范对应分析165

三、应用PAST进行典范对应分析165

四、应用Canoco进行典范对应分析和除趋势典范对应分析167

五、应用PCORD进行典范对应分析和除趋势典范对应分析172

第七节 无度量多维标定排序174

一、方法174

二、应用PAST和PCORD进行无度量多维标定排序175

第十一章 生理生态学中数据统计分析176

第一节 单因素方差分析176

第二节 双因素方差分析180

第三节 独立样本t检验和成对样本t检验182

一、独立样本t检验182

二、成对样本t检验183

第四节 重复测量数据的方差分析184

第五节 实验结果的图表形式188

一、三线表188

二、应用Excel作图的技巧189

第十二章 应用R语言进行生态数据分析193

第一节 R语言简介193

一、R语言的下载和安装193

二、R程序的一般运行方法195

三、R语言中的基本语句197

四、R语言中重要的生态与环境统计学程序包204

第二节 数据标准化程序204

第三节 二元数据的相似系数矩阵程序206

第四节 图解相关系数矩阵的程序208

一、程序208

二、运算结果208

第五节 用R语言计算物种多样性指数211

一、α多样性的计算211

二、β多样性计算程序211

第六节 应用R语言进行数量分类214

一、建立相异系数矩阵的程序214

二、构建聚类树的程序214

三、圆形聚类树状图的方法216

四、聚类和热图的构建方法218

五、最小生成树220

第七节 应用R语言进行多元回归树构建223

第八节 C-均值模糊聚类分析225

第九节 应用R语言进行生态位分析228

第十节 应用R语言进行排序分析229

一、排序程序229

二、组合聚类和排序的方法234

三、典范对应分析、对应分析、除趋势对应分析和约束排序分析程序237

四、非度量多维标定240

五、偏约束排序分析242

第十一节 R语言在构建决策树模型中的应用244

第十二节 应用R语言绘制图形的方法介绍248

一、基本作图语句248

二、用R语言生成热图251

三、排序二维散点图252

四、排序的三维散点图255

参考文献258

有关软件的参考文献260