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第一章 只是一个理论？1

什么是“理论”？什么是“事实”？7

第二章 狗、牛和白菜17

柏拉图的流毒贻害（死亡之手）18

雕刻基因库23

第三章 报春花的宏进化之路37

昆虫是最早的驯化者39

你是我的自然选择45

老鼠的牙齿58

再次说狗59

再次说花64

大自然作为选择者67

第四章 安静与缓慢的时间69

树的年轮72

放射性时钟75

碳85

第五章 就发生在我们眼前89

波德&马卡鲁岛的晰蜴92

实验室里4.5万代的进化94

孔雀鱼108

第六章 缺失的环节？你说的“缺失”是什么意思？117

“给我看鳄鸭！”124

“如果一只猴子能够生出一个人类婴儿，我就相信进化论，”126

“存在之巨链”的贻害126

生命来自大海131

我必须再次入海138

第七章 缺失的人们？不再缺失149

我现在仍然淘气地希望……154

只要去看看163

第八章 你自己在9个月内就做到了173

无人编舞175

可同“发育”类比的过程182

模拟欧椋鸟集群的细胞群188

酶193

接下来，尝试用线虫说明199

第九章 大陆方舟207

如果没有岛屿，世界将会怎样？208

新物种是如何诞生的209

“人们确实会幻想……”211

大地曾移动过吗？224

第十章 亲缘关系树235

骨与骨相连236

没有借用245

甲壳纲动物252

达西&汤普森会用电脑做些什么呢？256

分子比对261

分子钟273

第十一章 历史，写满我们的周围279

曾经自豪的翅膀284

失去眼睛290

不智能的设计294

第十二章 军备竞赛和“进化的神义论”309

太阳能经济310

奔跑，以停留在原处315

进化的神义论？322

第十三章 生命以此观之，何其壮哉329

“从自然界的战争中，从饥荒与死亡之中”331

“我们能想到的最高贵的事物”332

“最初被吹入”333

“吹入几种或一种生命形态中”338

“随着这颗行星依照固定的万有引力定律运转不停”339

“从这样一个简单的开端”344

“演化出了无穷无尽的、最美丽和最奇异的生命形式，并且这一演化过程仍在继续”349

附录 否认历史的人355

参考书目365

图片来源373