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第一章 分子流行病学研究相关知识1

第一节 分子流行病学的研究内容3

第二节 分子流行病学的生物学标志4

第三节 单核苷酸多态性6

第四节 分子流行病学的研究设计9

第五节 常用的技术方法10

第六节 哈迪温伯格平衡11

第二章 分子流行病学研究相关数据库介绍17

第一节 PDGene数据库19

第二节 ImMunoGeneTics数据库21

第三节 Immuno Polymorphism数据库23

第四节 Human Gene Mutation数据库28

第五节 HuGE Nayigator数据库30

第六节 PrognoScan数据库33

第七节 PROGgeneV2数据库38

第三章 分子流行病学研究报告规范43

第一节 加强观察性流行病学研究报告质量规范45

第二节 加强遗传学关联研究报告规范49

第三节 肿瘤标志物预后研究报告规范52

第四节 加强遗传风险预测研究规范54

第五节 加强免疫基因组学研究的报告规范57

第六节 加强传染性疾病的分子流行病学报告规范59

第四章 分子流行病学研究方法学质量评价工具65

第一节 方法学质量评价工具现状67

第二节 随机试验的方法学质量评价工具67

第三节 非随机试验的方法学质量评价工具70

第四节 分析性研究的方法学质量评价工具72

第五节 病例系列的方法学质量评价工具74

第六节 诊断准确性试验方法学质量评价工具76

第五章 分子流行病学研究系统评价/Meta分析方法79

第一节 系统评价/Meta分析的内涵81

第二节 系统评价/Meta分析的制作步骤84

第三节 Meta分析的效应量与模型90

第四节 Meta分析的图形解读92

第五节 基因表达基因芯片数据的Meta分析94

第六章 遗传关联性研究的Meta分析方法107

第一节 Meta分析的分类及制作要点109

第二节 Meta分析中对HWE的处理110

第三节 Meta分析的异质性来源110

第四节 Meta分析的多重检验校正方法114

第五节 Meta分析基因模型的选择118

第七章 分子流行病学研究系统评价/Meta分析报告规范127

第一节 报告规范的产生背景129

第二节 系统评价与Meta分析优先报告条目130

第三节 观察性研究Meta分析的报告规范132

第四节 人类基因组流行病学网络指南134

第五节 PLoS One遗传关联性研究Meta分析的清单139

第六节 Sagoo等的标准140

第八章 分子流行病学研究文献检索方法143

第一节 检索常用方法和途径145

第二节 资源类型及检索策略设计147

第三节 PubMed数据库及实际操作举例150

第四节 Embase数据库及实际操作举例158

第五节 SCI数据库及实际操作举例164

第六节 全文获取方案及注意事项167

第九章 分子流行病学研究系统评价/Meta分析选题173

第一节 选题的基本要素175

第二节 检索注册平台选题176

第三节 选题实例剖析183

第十章 PROSPERO注册平台及示例197

第一节 注册特点及范围199

第二节 研究方案的组成及注册实例展示202

第三节 注册平台的检索221

第十一章 病因性研究系统评价/Meta分析案例剖析227

第一节 单核苷酸多态性与疾病易感性/严重程度229

第二节 甲基化与疾病易感性/严重程度238

第三节 基因多态性与药物功效244

第四节 多重检验校正之假阳性结果报告率法264

第五节 方法学研究282

第六节 全基因组关联研究293

第七节 基因芯片研究332

第八节 基因多态性与疾病的诊断338

第十二章 应用Stata软件实现Meta分析347

第一节 Stata软件操作简介349

第二节 Stata软件实现Meta分析的方法353

第三节 数据准备及实现分析360

第十三章 应用R软件实现Meta分析375

第一节 程序包安装、加载及卸载377

第二节 数据集创建、读取与图形参数设定382

第三节 应用meta程序包实现389

第四节 应用metafor程序包实现400

第五节 应用rmeta程序包实现418

第六节 应用MetaOmics程序包426

第十四章 应用非编程软件实现Meta分析433

第一节 应用RevMan 5.3软件实现435

第二节 应用Comprehensive Meta-Analysis软件实现451