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第一部分　基础理论3

第一章　概述3

第一节　基因组研究简介3

第二节　蛋白质组5

第三节　蛋白质组学的分类7

第四节　蛋白质组学研究的用途11

第二章　功能基因组学与蛋白质组学18

第一节　人类基因组计划及功能基因组学20

第二节　蛋白质组研究的开端及含义35

第三章　双向凝胶电泳41

第一节　概述41

第二节　试剂、设备和溶液配制51

第三节　实验操作53

第四章　生物质谱72

第一节　质谱的基本原理73

第二节　生物质谱的软电离方式75

第三节　常用质谱质量分析器79

第四节　质谱法在蛋白质和多肽分析中的应用82

第五节　质谱法对蛋白质和多肽一级结构的分析和鉴定86

第五章　蛋白质芯片93

第一节　概述93

第二节　蛋白质芯片分析98

第三节　蛋白质芯片的优缺点及展望109

第六章　酵母双杂交系统111

第一节　双杂交和其他双成分系统111

第二节　酵母双杂交的原理及方法117

第三节　酵母双杂交系统的发展120

第四节　酵母双杂交系统的应用126

第七章　非胶蛋白质组学136

第一节　一维色谱与质谱联用136

第二节　多维色谱分离技术137

第三节　毛细管电泳-质谱联用140

第八章　亚细胞蛋白质组学143

第一节　概述143

第二节　亚细胞结构的分离146

第九章　生物信息学在蛋白质组研究中的应用155

第一节　生物信息学简介155

第二节　常见蛋白质数据库159

第三节　生物信息学在蛋白质研究中的应用161

第十章　蛋白质组学在医学中的应用185

第一节　蛋白质组学在消化系统疾病方面的应用186

第二节　蛋白质组学在生殖系统方面的应用189

第三节　泌尿系肿瘤的蛋白质组研究192

第四节　蛋白质组学在眼科方面的应用193

第五节　血液系统疾病蛋白质组学研究进展195

第六节　蛋白质组学在耳鼻咽喉科疾病机理研究中的应用197

第七节　蛋白质组学在呼吸系统中的应用199

第八节　医学检验方面的应用200

第九节　蛋白质组学在其他方面的应用203

第十节　总结与展望204

第十一章　蛋白质组学在药学研究中的应用207

第一节　蛋白质组学在药物作用靶点研究中的应用207

第二节　药物作用机制研究及新药筛选218

第三节　蛋白质组学在药物毒理学中的应用226

第四节　蛋白质组学在中药现代化中的应用230

第二部分　实际操作步骤237

步骤1　样品的制备237

步骤2　等电聚焦247

步骤3　聚丙烯酰胺凝胶电泳254

步骤4　凝胶染色269

步骤5　凝胶的扫描和图像分析273

步骤6　荧光差异凝胶电泳278

步骤7　斑点切除281

步骤8　样品褪色283

步骤9　凝胶内消化284

步骤10　微量脱盐和样品浓缩284

步骤11　多肽消化物的化学衍生化285

步骤12　质谱分析286

步骤13 MALDI-TOF MS的标定288

步骤14　数据库分析的准备290

步骤15　PMF肽指纹图谱数据库检测291

附录　故障排除293