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乏养（球）菌属1

无色杆菌属2

食酸菌属4

食酸菌属5

不动杆菌属7

放线杆菌属14

放杆菌属16

放线菌属16

颇陌菌属22

气球菌属22

气单胞菌属23

军院菌属 阿菲波菌属28

土壤杆菌属29

土壤杆菌属31

壤霉菌属31

壤霉菌属31

产碱菌属33

脂环酸芽孢杆菌属34

别弧菌属36

别许旺氏菌属36

另枝菌属37

异球菌属37

别根瘤菌属38

异单胞菌属，交替单胞菌属38

异单胞菌属39

嗜氨菌属40

厌氧螺菌属40

厌氧球菌属40

厌氧细杆菌属41

厌氧球菌属41

厌氧杆菌属 棍状厌氧菌属42

解硫胺芽孢杆菌属42

蛛网菌属45

隐秘杆菌属45

弓形菌属47

节杆菌属49

陌生菌属52

金杆菌属52

鸟杆菌属53

固氮根瘤菌属53

芽孢杆菌属54

类（拟）杆菌属68

类（拟）杆菌属68

浴者菌属 巴氏丝菌属73

巴尔通氏体属73

巴尔通氏体属74

伯杰氏菌属75

双歧杆菌属75

嗜胆菌属78

鲍特氏菌属78

疏螺旋体属79

短螺旋菌属81

慢生根瘤菌属81

布兰汉菌属82

布伦那菌属83

短芽孢杆菌属83

短杆菌属85

短螺旋体属89

短波毛单胞菌属89

短波毛单胞菌属91

布鲁氏菌属92

布兰特氏菌属93

布戴维采菌属94

伯克氏菌属 伯克霍尔德氏菌属94

布丘氏菌属100

鞘杆菌属102

弯曲菌属102

弯曲菌属103

嗜二氧化碳噬纤维菌属106

心杆菌属107

肉杆菌属108

酪杆菌属110

卡顿氏菌属110

西蒂西菌属111

纤维单胞菌属111

衣原体属112

衣原体属113

亲衣原体属114

色杆菌属114

华丽（金黄）杆菌属115

华丽（金色）单胞菌属120

柠檬酸杆菌属121

棍状杆菌属123

梭菌属124

联系菌属132

丛毛单胞菌属132

丛毛单胞菌属133

棒状杆菌属134

考克斯氏体属141

隐杆菌属142

短小杆菌属142

代尔夫特菌属143

皮（肤）杆菌属143

皮球菌属144

嗜皮菌属144

脱硫（硫还原）弧菌属145

小杆菌属 戴阿利斯特菌属145

偶蹄杆菌属146

狡诈球菌属146

蒙球菌属147

杜尔氏菌属147

爱德华氏菌属148

埃格氏菌属149

埃里希氏体属149

艾肯氏菌属150

稳杆菌属150

肠杆菌属151

肠球菌属156

肠弧菌属161

孤立球菌属162

欧文氏菌属162

欧文氏菌属164

丹毒丝菌属165

埃希氏菌属166

真（优）杆菌属168

尤因（欧文）氏菌属170

法肯莱姆氏菌属170

纤杆菌属171

黄素单胞菌属172

黄杆菌属173

黄杆菌属177

弗朗西丝氏菌属180

梭杆菌属180

鸡杆菌属182

加德纳氏菌属184

孪生球菌属184

土壤芽孢杆菌185

圆短链菌属186

戈登氏菌属186

柔芽孢杆菌属190

小链球菌属191

嗜血杆菌属191

哈夫尼亚菌属193

霍尔氏菌属194

创伤球菌属195

螺杆菌属195

螺杆菌属196

霍尔德曼氏菌属200

噬氢菌属201

惰球菌属202

紫（碘）杆菌属202

紫色杆菌属204

约翰逊氏菌属204

凯斯特氏菌属205

金氏菌属206

克雷伯氏菌属209

克雷瓦氏菌属212

柯克氏（球）菌属212

科泽氏菌属213

皮肤球菌属213

乳杆菌属214

乳球菌属220

勒克氏菌属221

军团菌属221

利夫森氏菌属224

勒米诺氏菌属225

钩端螺旋体属225

明杆菌属226

明串珠菌属228

李斯特氏菌属230

利斯顿氏菌属232

黄球菌属232

黄球菌属232

大球菌属233

曼海姆菌属233

马赛菌属234

巨单胞菌属236

中间根瘤菌属236

微杆菌属238

微球菌属241

微球菌属242

光岗菌属246

动弯杆菌属247

米勒氏菌属247

难养杆菌属248

莫拉氏菌属248

摩根氏菌属253

默里特氏菌属253

分枝杆菌属254

支原体属264

类香菌属268

奈瑟氏菌属269

纳斯特连柯（球）菌属270

诺卡氏菌属273

新鞘氨醇菌属278

肥杆菌属278

苍白杆菌属279

厄氏菌属280

寡源菌属281

口杆菌属281

东方次体属282

鸟杆菌属282

草酸杆菌属283

类芽孢杆菌属283

类芽孢杆菌属284

潘多拉菌属294

泛菌属，多源菌属294

副球菌属297

副乳杆菌属301

副斯加都伟氏菌属301

巴斯德氏菌属301

果胶杆菌属302

土杆菌属304

居鸽菌属305

消化球菌属305

亲胨菌属306

消化链球菌属306

消化链球菌属311

发光杆菌属311

光杆菌属312

动性球菌属313

邻单胞菌属314

卟啉单胞菌属314

布拉格菌属316

普雷沃氏菌属317

丙酸杆菌属320

产丙酸菌属321

变形杆菌属321

普罗非登斯菌属322

假交替单胞菌属，假异单胞菌属324

假单胞菌属325

假枝杆菌属335

冷杆菌属336

冷弯菌属337

兰恩氏菌属338

罗尔斯顿氏菌属338

劳特氏菌属341

拉思氏菌属341

根瘤菌属342

红球菌属344

立克次体属351

里默尔氏菌属353

里默尔氏菌属353

立肯氏菌属354

玫瑰单胞菌属354

罗氏菌属356

瘤胃杆菌属358

盐芽孢杆菌属358

嗜盐弧菌属358

沙门氏菌属360

血杆菌属362

八叠球菌属363

斯加都伟氏菌属363

施瓦茨氏菌属364

塞巴鲁德菌属364

月形单胞菌属364

小蛇菌属365

沙雷氏菌属366

许旺氏菌属希瓦氏菌属371

志贺氏菌属375

舒特勒沃斯氏菌属376

中华根瘤菌属377

中华根瘤菌属378

斯莱克氏菌属378

鞘氨醇杆菌属379

鞘氨醇菌属380

鞘氨醇单胞菌属381

鞘氨醇单胞菌属384

鞘氨醇单胞菌属386

鞘氨醇单胞菌属387

鞘氨醇盒菌属391

螺菌属391

葡萄球菌属392

寡养单胞菌属寡食单胞菌属400

链球菌属403

链霉菌属409

萨特氏菌属410

苏同（萨顿）氏菌属410

坦娜氏菌属411

塔特姆氏菌属412

土地菌属413

地杆菌属414

泰氏（替策氏）菌属414

泰氏菌属415

特拉伯氏菌属415

密螺旋体属415

养障菌属417

冢村氏菌属417

苏黎世菌属418

苏黎世杆菌属419

脲原体属419

游球菌属420

贪噬菌属420

韦荣氏球菌属421

弧菌属422

食谷菌属429

枝芽孢杆菌属430

沃格氏菌属431

华诊原体属432

沃特氏菌属432

威克氏菌属433

魏斯氏菌属434

沃林氏菌属435

黄单胞菌属435

黄单胞菌属437

致病杆菌属438

致病杆菌属439

耶氏菌属440

约克菌属441

扎瓦氏菌属442

动胶菌属442

附录1：菌属类别查询表444

附录2：常用细菌底物利用实验的有机化合物453

附录3：医学常见酵母菌种456

附录4：主要的动物致病原虫459

附录5：主要的医学病毒460

附录6：抗菌药物名称462

主要参考文献467

显微镜下的菌体形态469

培养基上菌落形态472