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第一部分R语言2

第1章 简介2

1.1本章目标2

1.2 R是什么2

1.3安装R3

1.4选择一个IDE4

1.4.1 Emacs+ESS4

1.4.2 Eclipse/Architect4

1.4.3 RStudio5

1.4.4 Revolution-R5

1.4.5 Live-R5

1.4.6其他IDE和编辑器6

1.5你的第一个程序6

1.6如何从R中获得帮助7

1.7安装其他相关软件9

1.8小结9

1.9知识测试：问题10

1.10知识测试：练习10

第2章 科学计算器11

2.1本章目标11

2.2数学运算符和向量11

2.3变量赋值15

2.4特殊数字17

2.5逻辑向量18

2.6小结20

2.7知识测试：问题20

2.8知识测试：练习20

第3章 检查变量和工作区22

3.1本章目标22

3.2类22

3.3不同类型的数字23

3.4其他通用类24

3.5检查和更改类26

3.6检查变量29

3.7工作区32

3.8小结33

3.9知识测试：问题33

3.10知识测试：练习34

第4章 向量、矩阵和数组35

4.1本章目标35

4.2向量35

4.2.1序列37

4.2.2长度38

4.2.3命名39

4.2.4索引向量39

4.2.5向量循环和重复41

4.3矩阵和数组43

4.3.1创建数组和矩阵43

4.3.2行、列和维度45

4.3.3行名、列名和维度名46

4.3.4索引数组47

4.3.5合并矩阵47

4.3.6数组算术48

4.4小结50

4.5知识测试：问题50

4.6知识测试：练习51

第5章 列表和数据框52

5.1本章目标52

5.2列表52

5.2.1创建列表52

5.2.2原子变量和递归变量54

5.2.3列表的维度和算术运算55

5.2.4索引列表56

5.2.5向量和列表之间的转换58

5.2.6组合列表60

5.3 NULL61

5.4成对列表64

5.5数据框65

5.5.1创建数据框65

5.5.2索引数据框68

5.5.3基本数据框操作69

5.6小结71

5.7知识测试：问题71

5.8知识测试：练习72

第6章 环境和函数73

6.1本章目标73

6.2环境73

6.3函数76

6.3.1创建和调用函数76

6.3.2向其他函数传递和接收函数80

6.3.3变量的作用域82

6.4小结84

6.5知识测试：问题84

6.6知识测试：练习84

第7章 字符串和因子86

7.1本章目标86

7.2字符串86

7.2.1创建和打印字符串87

7.2.2格式化数字88

7.2.3特殊字符90

7.2.4更改大小写91

7.2.5截取字符串91

7.2.6分割字符串92

7.2.7文件路径93

7.3因子94

7.3.1创建因子94

7.3.2更改因子水平96

7.3.3去掉因子水平96

7.3.4有序因子97

7.3.5将连续变量转换为类别98

7.3.6将类别变量转换为连续变量99

7.3.7生成因子水平100

7.3.8合并因子100

7.4小结101

7.5知识测试：问题101

7.6知识测试：练习101

第8章 流程控制和循环103

8.1本章目标103

8.2流程控制103

8.2.1 if和else103

8.2.2矢量化的if105

8.2.3多个分支106

8.3循环108

8.3.1重复循环108

8.3.2 while循环110

8.3.3 for循环111

8.4小结113

8.5知识测试：问题113

8.6知识测试：练习113

第9章 高级循环115

9.1本章目标115

9.2 replication115

9.3遍历列表116

9.4遍历数组122

9.5多个输入的应用函数124

9.6拆分-应用-合并（Split-Apply-Combine）126

9.7 plyr包127

9.8 小结130

9.9知识测验：问题130

9.10知识测试：练习131

第10章包133

10.1本章目标133

10.2加载包133

10.2.1搜索路径135

10.2.2库和已安装的包136

10.3安装包137

10.4维护包139

10.5小结139

10.6知识测试：问题140

10.7知识测试：练习140

第11章 日期和时间141

11.1本章目标141

11.2日期和时间类141

11.2.1 POSIX日期和时间142

11.2.2 Date类143

11.2.3其他日期类144

11.3日期与字符串的相互转换144

11.3.1解析日期144

11.3.2格式化日期145

11.4时区145

11.5日期和时间的算术运算147

11.6 lubridate149

11.7小结153

11.8知识测试：问题153

11.9知识测试：练习153

第二部分 数据分析工作流156

第12章 获取数据156

12.1本章目标156

12.2内置的数据集156

12.3读取文本文件157

12.3.1 CSV和制表符分隔（Tab-Delimited）文件157

12.3.2非结构化文本文件161

12.3.3 XML和HTML文件161

12.3.4 JSON和YAML文件163

12.4读取二进制文件165

12.4.1读取Excel文件165

12.4.2读取SAS、 Stata、 SPSS和MATLAB文件167

12.4.3读取其他文件类型167

12.5 Web数据168

12.5.1拥有API的网站168

12.5.2抓取网页169

12.6访问数据库171

12.7小结174

12.8知识测试：问题174

12.9知识测试：练习174

第13章 数据清理和转换175

13.1本章目标175

13.2清理字符串175

13.3操作数据框180

13.3.1添加和替换列180

13.3.2处理缺失值181

13.3.3在宽和长表格之间进行转换182

13.3.4使用SQL183

13.4排序184

13.5函数式编程185

13.6小结188

13.7知识测试：问题188

13.8知识测试：练习189

第14章 探索和可视化190

14.1本章目标190

14.2汇总统计190

14.3三种绘图系统194

14.4散点图195

14.4.1第一种方法：base绘图法195

14.4.2第二种方法：lattice图形系统200

14.4.3第三种方法：ggplot2图形系统207

14.5线图212

14.6直方图220

14.7箱线图232

14.8条形图236

14.9其他的绘图包和系统242

14.10小结243

14.11知识测试：问题243

14.12知识测试：练习244

第15章 分布与建模245

15.1本章目标245

15.2随机数246

15.2.1示例函数246

15.2.2从分布中抽样247

15.3分布248

15.4公式248

15.5第一个模型：线性回归250

15.5.1比较和更新模型252

15.5.2绘图和模型检查257

15.6其他模型类型261

15.7小结262

15.8知识测试：问题263

15.9知识测试：练习263

第16章 程序设计264

16.1本章目标264

16.2信息、警告和错误264

16.3错误处理267

16.4调试270

16.5测试273

16.5.1 RUnit273

16.5.2 testthat276

16.6魔法277

16.6.1将字符串转换成代码277

16.6.2把代码转换成字符串279

16.7面向对象编程280

16.7.1 S3类281

16.7.2引用类282

16.8小结287

16.9知识测试：问题287

16.10知识测试：练习288

第17章 制作程序包289

17.1本章目标289

17.2为什么要创建软件包289

17.3先决条件289

17.4包目录结构290

17.5你的第一个包291

17.6为包撰写文档293

17.7检查和构建包296

17.8包的维护297

17.9小结298

17.10知识测试：问题299

17.11知识测试：练习299

第三部分附录302

附录A变量的属性302

附录B R中其他可做的事情305

附录C问题答案307

附录D练习答案315

参考文献339

关于封面341