图书介绍

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林木遗传模型统计分析及R语言实现
  • 童春发,施季森编著 著
  • 出版社: 北京:科学出版社
  • ISBN:9787030420701
  • 出版时间:2014
  • 标注页数:302页
  • 文件大小:44MB
  • 文件页数:312页
  • 主题词:程序语言-程序设计-应用-林木育种-遗传育种-统计分析

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图书目录

1 固定效应模型和随机效应模型1

1.1 固定效应模型1

1.1.1 模型表达式1

1.1.2 无约束模型的参数估计4

1.1.3 约束模型的参数估计7

1.2 随机效应模型9

1.2.1 方差分量估计9

1.2.2 方差分量的假设检验14

1.3 R语言程序18

1.3.1 无约束固定效应模型计算程序18

1.3.2 约束固定效应模型计算程序19

1.3.3 随机效应模型计算程序21

思考与练习23

2 半同胞子代测定遗传模型24

2.1 单点多株小区试验统计模型24

2.1.1 一般配合力24

2.1.2 遗传方差估计与假设检验25

2.1.3 遗传力27

2.1.4 遗传相关系数29

2.2 多点多株小区试验统计模型30

2.2.1 一般配合力31

2.2.2 遗传方差估计与假设检验31

2.2.3 遗传力35

2.2.4 遗传相关系数36

2.3 实例分析及其R语言计算程序38

2.3.1 单点多株小区试验实例38

2.3.2 多点多株小区试验实例46

思考与练习58

3 巢式设计遗传模型59

3.1 包含区组和重复的巢式设计统计模型59

3.1.1 固定效应模型59

3.1.2 随机效应模型60

3.1.3 遗传力63

3.1.4 遗传相关系数64

3.2 包含区组但不含重复的巢式设计统计模型66

3.2.1 固定效应模型66

3.2.2 随机效应模型66

3.2.3 遗传力69

3.2.4 遗传相关系数70

3.3 不包含区组和重复的巢式设计统计模型71

3.4 实例及R语言计算程序73

3.4.1 包含区组和重复的巢式设计实例73

3.4.2 包含区组但不包含重复的巢式设计实例84

思考与练习92

4 因子交配设计遗传模型93

4.1 多地点多区组因子交配设计统计模型93

4.1.1 固定效应模型94

4.1.2 随机效应模型95

4.1.3 遗传力102

4.1.4 遗传相关系数106

4.2 单地点多区组因子交配设计统计模型108

4.2.1 固定效应模型108

4.2.2 随机效应模型109

4.2.3 遗传力110

4.2.4 遗传相关系数112

4.3 单地点不含区组因子交配设计统计模型114

4.4 实例及R语言计算程序115

4.4.1 多地点多区组因子交配设计实例115

4.4.2 单地点多区组因子交配设计实例129

思考与练习140

5 双列杂交设计遗传模型141

5.1 半双列杂交遗传模型142

5.1.1 固定效应模型142

5.1.2 随机效应模型143

5.1.3 遗传力145

5.1.4 遗传相关系数146

5.2 全双列杂交遗传模型147

5.2.1 固定效应模型148

5.2.2 随机效应模型148

5.2.3 遗传力150

5.2.4 遗传相关系数151

5.3 多地点半双列杂交遗传模型153

5.3.1 固定效应模型153

5.3.2 随机效应模型154

5.3.3 遗传力155

5.3.4 遗传相关系数157

5.4 多地点全双列杂交遗传模型158

5.4.1 固定效应模型158

5.4.2 随机效应模型159

5.4.3 遗传力162

5.4.4 遗传相关系数163

5.5 实例及R语言计算程序165

5.5.1 半双列杂交设计实例165

5.5.2 全双列杂交设计实例173

5.5.3 多地点全双列杂交设计实例181

思考与练习193

6 多地点多年份家系试验遗传模型194

6.1 多地点家系试验统计模型194

6.1.1 固定效应模型194

6.1.2 随机效应模型195

6.1.3 遗传相关系数197

6.2 多年份家系试验统计模型198

6.2.1 固定效应模型199

6.2.2 随机效应模型200

6.2.3 遗传相关系数202

6.3 多地点多年份家系试验统计模型204

6.3.1 固定效应模型204

6.3.2 随机效应模型206

6.3.3 遗传相关系数209

6.4 实例及R语言计算程序211

6.4.1 多地点家系试验实例211

6.4.2 多年份家系试验实例219

6.4.3 多地点多年份家系试验实例229

思考与练习242

7 方差分量约束极大似然估计243

7.1 ML估计243

7.2 REML估计245

7.3 实例及R语言计算程序248

思考与练习255

8 育种值的最佳线性无偏预测256

8.1 混合模型方程256

8.2 动物模型260

8.3 多地点半同胞子代测定试验育种值计算265

思考与练习275

参考文献276

附录A 矩阵基本概念和运算278

A1 矩阵的定义278

A2 矩阵的运算280

A3 矩阵的分块运算284

A4 特征值和特征向量288

A5 正定矩阵和半正定矩阵293

思考与练习295

附录B 林木遗传模型统计分析软件297

B1 半同胞子代测定遗传模型分析软件HalfsibSS297

B2 巢氏设计遗传模型分析软件WinNC1297

B3 因子交配设计遗传模型分析软件WinNC2298

B4 双列杂交设计配合力分析软件GSCA298

附录C R语言简介300

C1 R语言软件下载与安装300

C2 R语言工作窗口300

C3 R语言矩阵运算符和控制语句301

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